三峡工程影响水域重要水生生物遗传资源保存库
1核酸库
通过提取并保存水工程建设和运行不同时期影响水域内重要水生生物的DNA、RNA等核酸资源，构建基因文库，开展遗传多样性监测，从遗传角度评估物种受水工程影响程度及保护需求。
DNA样品提取与基因（DNA）文库构建及保存：从保存物 种的组织样品提取DNA并构建DNA文库，在-20℃低温冰箱和- 80℃超低温冰箱中进行保存。目前已入库保存近150余种鱼类的 DNA样本3万余份，其中包括三峡后续规划重点保护56个物种中的31种。
RNA样品提取与基因（cDNA）文库构建及保存：从保存物种的组织样品提取RNA并构建cDNA文库，在-80℃超低温冰 箱和液氮罐中进行保存。
2细胞库
针对水工程建设和运行不同时期影响水域内珍稀濒危特有鱼类，开展细胞原代与传代培养以及细胞系构建、精子超低温冷冻，并在-196℃液氮罐中超低温冷冻保存，提升受水工程胁迫鱼类的保护、保存、保育和重建恢复能力。
鱼类细胞培养及冷冻保存：开展鱼类组织细胞的原代及传代养、构建细胞系并冷冻保存。目前已入库在-196℃液氮罐中保存14种鱼类的细胞样本500余份。
鱼类精子超低温保存：针对不同鱼类种类，通过研究配制 最佳精子冷冻保存液，对鱼类精子进行超低温冷冻保存。目前已入库在-196℃液氮罐中保存12种鱼类的精子样本600余份。
3标本库
通过保存保藏水工程建设和运行不同时期影响水域内重要水生生物的各类组织样本和标本，支撑核酸库和细胞库运行，留存其生物学和种群动态数据资料，为生态调度、生态需水和栖息地修复等保护修复措施实施提供基础数据。
剥制和浸制标本制备与保存：对保存物种的个体、组织、器官等制成剥制或浸制标本，并进行保存和展示。目前已入库保存剥制标本3件；浸制标本7000余件（鉴定标本5000余件，尚未完成鉴定标本2000余件）。
组织样本低温冷冻保存：对鱼类的肌肉、鳍条、肝脏等组织开展不同介质的冷冻保存工作，并与DNA、RNA等核酸样本记录对应。已入库保存130余种水生动物的组织样品142000余份。
4水生生物展示厅
展示长江流域受到水利工程建设和运行影响的珍稀、濒危、特有、经济鱼类的浸制、剥制标本148种300余件，其中包括三峡后续规划重点保护56个物种中的31种；国家一级保护动物中华鲟标本3份4尾，长江鲟标本1份2尾，江豚标本2份1尾；剥制标本2件：分别是中华鲟1件，江豚1件；还有1份江豚的骨骼标本，其余浸制标本154份。
